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Le Congrès est l’organe suprême du SYNRAPCI. Il se tient tous les trois (3) ans.
Le congrès extraordinaire peut se réunir sur proposition du Bureau Exécutif à la majorité des 2/3 de ses membres. La convocation doit être notifiée à l’ensemble des membres du congrès dans un délai maximum de 15 jours avant son ouverture.
Le congrès (ordinaire ou extraordinaire) est composé :
- du Bureau Exécutif ;
- des délégués du personnel ;
- des délégués syndicaux ;
- des représentants syndicaux ;
- des commissaires aux comptes.

Tous les syndiqués SYNRAPCI / SIR, membre remplissant les conditions d’électeurs peut prendre part à l’élection du secrétaire général et des commissaires aux comptes.
Le congrès peut se réunir en session extraordinaire sur proposition du Secrétaire Général appuyé par la moitié des membres du bureau exécutif. Dans ce cas l’ordre du jour doit être précis. Il peut avoir lieu à la demande des 2/3 des membres en cas de fautes graves ou de prise de décision importante dépassant la compétence du Bureau Exécutif.
La convocation d’un tel congrès doit être notifiée dans un délai maximum de 15 jours avant son ouverture.
Le congrès peut se réunir en session extraordinaire sur proposition de la majorité de représentants syndicaux appuyés par une pétition signée de la moitié des syndiqués.

Organe de concertation, l’Assemblée Générale Ordinaire a pour tâches essentielles :
- de préparer le congrès et de connaitre tous les problèmes que devra lui soumettre le Bureau Exécutif ;
- d’apprécier le bilan à mi-parcours du Bureau Exécutif.
Elle est composée de tous les membres du SYNRAPCI.
L’Assemblée Générale Ordinaire se réunit une fois par an à un lieu donné, désigné par le Bureau Exécutif. L’Assemblée Générale Ordinaire se réunit chaque année au mois de juin. Pour délibérer valablement l’Assemblée Générale doit réunir les 2/3 des membres. Si cette condition n’est pas remplie, elle est convoquée à nouveau à 15 jours d’intervalles. A cette seconde réunion, elle délibère quel que soit le nombre des membres présents.

L’Assemblée Générale Extraordinaire se réunit chaque fois que cela s’avère nécessaire sur convocation du Secrétaire Général ou à la demande des 2/3 des membres ou à la majorité des représentants syndicaux pour discuter d’un problème urgent ou grave tendant à nuire au SYNRAPCI et prendre une décision qui s’impose pour la bonne marche du SYNRAPCI.

Le Bureau Exécutif est l’organe exécutif du SYNRAPCI. Ses membres sont nommés par le Secrétaire Général qui lui est élu au scrutin secret à la majorité absolue au premier tour et à la majorité relative au second tour. La durée de son mandat est de trois (03) ans renouvelables une seule fois. Tous les membres sont responsables devant le Secrétaire Général sauf les commissaires aux comptes tous élus dans les mêmes conditions que le Secrétaire Général. Le Bureau Exécutif est chargé de l’application de la politique du SYNRAPCI décidée par le congrès. Le Bureau Exécutif se compose comme suit :
- 1 Secrétaire Général,
- 1 Secrétaire Général adjoint
- 1 secrétaire chargé des Relations Extérieurs ;
- 1 secrétaire chargé de l’Information et de la Communication ;
- 1 secrétaire chargé de la mobilisation et de l’Organisation ;
- 1 secrétaire chargé de la formation syndicale et des questions disciplinaires ;
- 1 secrétaire chargé de la condition féminine ;
- 1 secrétaire chargé des affaires sociales ;
- 1 secrétaire chargé des contentieux et des revendications ;
- 1 secrétaire chargé de la santé ;
- 1 secrétaire chargé du sport et de la culture et des loisirs ;
- 1 trésorier Général ;
- 1 adjoint au trésorier Général.
Le Bureau Exécutif veille au bon fonctionnement du SYNRAPCI. Il se réunit tous les deux mois sur convocation du Secrétaire Général. Le Bureau Exécutif décide à la majorité absolue des voix. Celle du Secrétaire Général est prépondérante en cas d’égalité. .